holas!..
no entiendo a que te refieres cuando hablas de "aplicación inactiva". Pero viendo que ya sabes como monitoriarla supongo que solo resta matar la aplicación.
Quiza te sirva matando el proceso de la aplicación. En el buscador hay un monton de ayuda de esto. Fijate este
link a ver si te sirve. Ahi dice como matar el proceso pasandole como parametro el nombre del ejecutable.
Espero que te sirva.
Mucha suerte!