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Es mejor dejar el año, mes, dia en columnas separadas que meterlas en un solo campo. La razon es que en vez de tener un solo indice tenes 3>, se hace muy optimo las consultas y es mas flexible porque tampoco tienes que hacer substring (por ejemplo, para llegar al dia) y ademas los campos se pueden dejar tipo INTEGER que es mas optimo que tipo STRING.
Por lo demas, tampoco es de enredarse mucho la pita. Hay un principio (el de Paretto) que dice que el 80% del esfuerzo se concentra en el 20% de las cosas. Determina que es lo mas probable y optimiza para ello, pero no te pongas a complicarte (igual, la optimizacion prematura causa mas lios que lo que mejora).
En terminos generales, tunear la BD, tener suficiente RAM y si se puede contar con discos en RAID o al menos 2 separados (1 para el OS otro para la BD) es mas que suficiente en la mayoria de los casos.
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