Hola,
Puedes eliminar ciertas advertencias desde "Window -> Preferences -> Validation", ahora bien, vayamos por partes:
Cita:
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warning: Tag (br) should be an empty-element tag.
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Se trata de que "br" es una etiqueta que ha de cerrarse ella misma. Es decir, prueba a cambiar: < br > por < br / >.
Cita:
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warning: Tag (link) should be an empty-element tag.
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Es el mismo caso que el anterior. La etiqueta ha de cerrarse ella misma y se hace de la misma forma.
Cita:
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warning: Undefined attribute name (<?php echo $Aux; ?>).
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Eso es que el "analizador" se hace un lío con HTML y PHP, puesto que se mezclan de tal forma que se toma al código PHP como un atributo de la etiqueta en cuestión, atributo que no existe... y de ahí la advertencia.
Cita:
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warning: Undefined attribute name (languaje).
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Como en los primeros casos, estas advertencias tienen que ver con XHTML. En XHTML las etiquetas "solitarias" se tienen que cerrar, y, el atributo "language" no existe, basta con el atributo "type" en este caso.