Con linux no he probado, pero si con Windows.
Lo que no entiendo es usar D6 bajo Linux
Hasta donde llego, D6 debe estar instalado en un Windows. Por tanto, instalaría el vmware Converter en el windows de D6, y diría que crease un "vmware StandAlone" a partir de la partición C:. El resultado lo guardaría en un disco duro USB externo.
Finalizado, conectas ese disco duro a tu máquina Linux.
desde tu máquina Linux, instalas vmware Player, y al ejecutarlo, le dices que abras la imagen del disco USB.
Espero sea lo que necesitas.