Hola.
En mi empresa tenemos que actualizar gran cantidad de datos a muchas oficinas remotas diariamente. Crear conexiones remotas y mantenerlas mientras se hacen las actualizaciones ralentizaba mucho todo el proceso, así que al final optamos por crear un programa "sincronizador", como tu comentas.
En nuestro caso lo que hacemos al crear las actualizaciones que se van a enviar a cada oficina es leer todas las tablas que se deben actualizar y almacenar los datos en archivos de texto con campos de ancho fijo. Este proceso es bastante rápido y, no ocupa demasiado espacio. A continuación se comprimen todos estos archivos en un .zip que se alamacena en un campo blob de la base de datos. En total el proceso no lleva mas de un par de minutos, te aseguro que es un gran cantidad de datos. Todo lo realiza un simple modulo de la aplicación principal, y por lo general solo se hace una vez al día.
En la parte de la oficina remota, se ha diseñado otra aplicación que, entre otras cosas, se encarga de descargar el archivo (previa comprobación de que no se había procesado ya, claro), lo descomprime, y lee cada archivo de datos. De esta forma la aplicación genera y ejecuta las consultas que necesite en cada oficina, que no tienen por que ser las mismas, según de que datos se trate.
Otra opción, si en cada oficina sabes que consultas se deben ejecutar en la o las otras, pues directamente en el archivo generas las consultas desde el origen. Puedes enviar el archivo por email, por ftp, en una consulta, descargandolo... en fin, de muchas maneras diferentes. Con un pequeño motor que se encargue de ejecutar cada consulta, tendrías tu actualización lista en poco tiempo.
Cada caso es diferente. Te digo que para nosotros ésta era la mejor opción, pero en otros casos puede ser mas interesante hacer una conexión remota y actualizar lo necesario.
En fin, es una idea
mas.
Saludos.