No entiendo exactamente que quieres hacer, pero el directorio de trabajo dentro de un icono se hace de esta manera.
Cita:
[Icons]
Name: "{group}\{cm:UninstallProgram,{#MyAppName}}"; Filename: "{uninstallexe}"
Name: "{group}\CCS Contract"; Filename: "{app}\Contract.exe"; WorkingDir: "{app}"
Name: "{userdesktop}\CCS Contract"; Filename: "{app}\MailSend.exe"; WorkingDir: "{app}"
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La propiedad WorkingDir es donde tú le asignas el directorio de trabajo al icono. Seria que le agregaras lo que comentas \01, \02, \03, etc... algo así
Cita:
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Name: "{group}\CCS Contract"; Filename: "{app}\01\Contract.exe"; WorkingDir: "{app}\01"
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Salud OS.