Yo también apunto hacia esos dos elementos :
1º Fuente de alimentación
2º Ventiladores (de fuente o de micro).
No sé si tu placa base permite la monitorización de la temperatura de la CPU. Ahí podrías observar si te pasa cuando sube la temperatura de la CPU.
Si fuera así, podes hacer una simple prueba. Quítale la tapa a tu carcasa del ordenador. Suele aliviar bastante el problema de temperaturas de CPU y/o fuente de alimentación.
Si tu fuente de alimentación no es de estas nuevas 'modulares' ni nada especial, te recomiendo que por poco más de 15-20 euros intentes conseguir una fuente nueva y reemplazar la que tienes. Creo que ese dinero lo inviertes bien en los quebraderos de cabeza que estás teniendo. Si no es problema de la fuente, siempre tendrás una fuente de alimentación de repuesto. Algunas veces se agradece mucho tenerla cerca, porque generalmente más tarde o más temprano es de los elementos que primero dejan de funcionar. Sobre todo debido también a la 'calidad' de nuestros proveedores de electricidad.
Saludos