Hola,
Respecto de instalar GNome o KDE... instala ambos. Es muy sencillo cambiar de uno a otro al iniciar sesión en el sistema, así que, si no hay problemas de espacio instala ambos y luego elige el que mejor te parezca. Siempre contarás con el otro si te hace falta.
Sobre la "virtualización" a que te refieres, otros compañeros sabrán decirte, y más si es sobre GNU/Linux, pero, también puedes echar un vistazo a cierto
apartado en Kriptópolis que le dedican en exclusiva al tema. El programa de que suelen tratar es VMware y, bueno,
esta es su página Web. ¡Suerte en todo caso!