Creo que la respuesta llega algo tarde, pero bueno para el que le sirva digo son las 2:00 de madrugada y no tengo sueño jeje.
Existe un programa llamado Sqlite admin con el cual puedes administrar tus bases de datos, sobre el acceso a SQLite desde delphi con controles Zeos personalmente no te lo recomiendo ya que le he intentado y no he podido (no es que no se pueda , yo no pude), yo uso otros componentes para conectarme a sqlite aqui te dejo el enlace :
http://www.aducom.com/sqlite/
Te proporcionan varios componentes que te facilitan la conexion y el tiempo de desarrollo, lo demas queda de tu parte la creacion de tablas en tiempo de ejecucion , etc.
Saludos.