Pues habiendo pasado 2 minutos desde que abrí este hilo, ya encontré la mitad de mi duda, que es la solucion al error que me da apache al inicializarlo teniendo configurado php como módulo de este.
Se me ocurrio cambiar el nombre de el archivo "php5apache2.dll" por "php5apache.dll" ejecute apache y funciona muy bien, hice un script de prueba y tambien funcionó, así que por lo pronto lo dejaré asi, pero sigo teniendo la duda de que forma es la mejor/mas-recomendable, "CGI binary" o "Apache Module".
Saludos.
Edito:
Pues como iva a ser, por error me descargue la versión 1.3.35 de apache, era imposible que me funcionara php con un módulo para apache 2.0. Como que ando algo dormido
