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Mira
Yo haria lo siguiente:
- Bajar la version de mySQL en ZIP (la que no es instalable)
- Copiar la base de datos del servidor donde estas trabajando y testeando el programa.
Recuerda, cada base de datos en mySQL es una subcarpeta del directorio data
Entonces, cuando copies por ejemplo la base de datos sistema al directorio data del mysql que distribuiras, no hara falta que insertes ningun script ni realices ninguna tarea desde el instalador.
Incluso puedes copiar la base de datos mysql ( carpeta mysql dentro de data ) y automaticamente estaras copiando usuarios, permisos, etc.
Ten cuidado en que ambos mysql (el q pruebas y el q distribuyas) sean la misma version.
Estoy seguro de que debe haber alguna version de mySQL que sea "lite" ( digamos esencial ) es decir que contenga solo lo necesario y que ocupe poco espacio cosa de que tu instalador no ocupe mucho tamaño...
Es solo cuestion de copiar carpetas, y luego agregar el directorio entero de mySQL al script de innosetup, construir el instalador, y listo...
Suerte
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