He localizado el problema.
Resulta que utilizaba la función :
Código:
WinWord.ActiveWindow.Close(wdDoNotSaveChanges);
para cerrar el documento activo.
Cuando abró Word no siendo visible, parece ser que no cierra sólo este documento sino toda la aplicación y claro cualquier cosa que quisiera hacer posteriormente con Word era imposible.
Gracias por vuestra ayuda